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高性能計算“工業論壇”
來源: 顏偉/
北京并行科技有限公司
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2014-10-24

中國計算機學會青年計算機科技論壇-廣州分論壇

CCF Young Computer Scientists & Engineers Forum-Guangzhou Branch

CCF YOCSEF廣州

2014118周六14:00-17:00

廣州番禺長隆酒店206會議室(廣州市番禺區迎賓路)舉行

專題報告會和Club,敬請光臨

報告會主題

高性能計算“工業論壇”

 

隨著計算能力達到百億億次的艾級超級計算機從探討進入研制階段,全球高性能計算將從“P時代”(千萬億次)步入“E時代”(百億億次),如此龐大的超級計算機對超大規模并行計算應用的需求將前所未有的強烈。較之前高性能計算主要應用與科學研究的不同,目前顯著趨勢是高性能計算延伸到科研領域之外,正展現出強大的延展性,與金融、互聯網、石油、鋼鐵、工業設計、文化創意等各行各業之間的交叉關聯變得前所未有的緊密。同時,高性能計算與云計算、大數據之間的交叉融合趨勢越發明顯,成為推動全球信息產業發展的三大動力之一。

眾所周知,廣州目前擁有全世界最快的超級計算機天河二號,所以有句話:世界高性能計算看中國,而中國高性能計算在廣州。在中國計算機學會高性能計算專業委員會的大力支持下,借這次2014年全國高性能計算學術年會在廣州舉行的“東風”,CCF YOCSEF廣州北京并行科技有限公司聯合舉辦高性能計算“工業論壇”,主要就高性能計算在企業的應用進行探討,論壇很榮幸地邀請到來自中國石油、中國石化、攀鋼集團、深圳華大基因、NVIDIA公司和中國科學院深圳先進技術研究院的頂尖專家和學者介紹他們在高性能計算的應用成果,并舉行圓桌會議對未來高性能計算的發展和趨勢進行頭腦風暴。

118,讓我們相聚廣州番禺長隆酒店,一起來欣賞這次高性能計算的饕餮盛宴。

誠摯邀請各位同仁參加,期待您的光臨!

                                    主辦: CCF YOCSEF廣州,北京并行科技有限公司

程序

13:30 簽到

14:00  報告會

特邀講者:張金波,高級工程師,攀鋼集團研究院信息研究所數字技術研究室

演講題目:企業分布式存儲高效擴展機制

特邀講者:賴能和,副總工,中國石油集團東方地球物理公司研究院

演講題目:大數據對高性能計算應用的需求分析

特邀講者:楊尚琴,主管師,中國石化石油物探技術研究院

演講題目:MPI-3.0新特性及其應用

特邀講者:魏彥杰,副研究員,中國科學院深圳先進技術研究院高性能計算中心

演講題目:基于BSP圖處理系統的高效并行List Ranking算法

特邀講者:王澤寰,高性能計算開發技術工程師,NVIDIA

演講題目:一種改進的圖像連通區域標記的并行算法及其在GPU上的實現

特邀講者:郭貴鑫,高性能計算研發工程師,深圳華大基因研究院

演講題目:天河二號上基因組裝關鍵算法的性能建模

演講題目:基于GPU加速的宏基因組基因聚類方法

16:40-18:00  Panel環節

Panel討論:待定

特邀嘉賓:待定

 

執行主席:陳健 博士 北京并行科技有限公司總經理,CCF YOCSEF總部委員

王健宗 博士 廣州中國科學院先進技術研究所,CCFYOCSEF廣州副主席

CCF廣州執行委員,CCF大數據專家委員會委員

論壇主頁:

http://hpcchina2014.csp.escience.cn/dct/page/70027

參加人員:IT領域專業人士、研究生、媒體、其他有興趣者。

 

報名聯系人:

王健宗(Email:13352878877@163.com ; Tel: 13352878877)

顏偉(Email:yanwei@paratera.com ; Tel: 18122266618)

請務必填寫下附參會回執,于1103前回復郵件

姓名

 

單位名稱

 

聯系電話

 

Email

 

是否參加Club活動(11月6日20:00~24:00

 

是否參加論壇活動(11月8日14:00~17:00

 

 

溫馨提示:本次活動獲北京并行科技公司贊助,工業論壇前于11620:00~24:00在長隆酒店附近的The Brew酒吧(華南碧桂園西門,靠近工商銀行)組織Club活動,敬請參與!

本次兩次活動不作交通安排,參會人員需自行前往,會議交通費和住宿費等自理,給您帶來不便,請見諒。

 

特邀講者 張金波 高級工程師

攀鋼集團研究院有限公司信息研究所數字技術研究室主任,2011年聘高級工程師,中國計算機學會會員。2005年獲得中華人民共和國計算機技術與軟件專業技術資格(水平)系統分析師證書。2010年獲評攀鋼集團專家資源庫成員,2013年獲評鞍鋼集團專家資源庫成員,2013年獲評攀枝花市信息化專家庫成員,2013年獲評攀枝花市學術和技術帶頭人后備人選。主持和參與的項目共獲得18項軟件著作權。主要研究領域為信息系統開發,系統分析與集成,信息安全,網絡架構。

報告摘要:在研究文件存儲基礎設備與技術發展的基礎上,提出一種可高效擴展的分布式存儲機制,將企業中已有的服務器和存儲設備作為分布式存儲的存儲單元,將文件作為存儲對象,研究的主要內容就是建立一種高效率甚至是零等待時間的可以隨時擴展或減少存儲單元的分布式存儲機制。企業中存在的服務器和存儲設備較多時,利用該分布式存儲機制后存儲性能會得到較大的提升,管理人員文件管理的勞動強度將大大降低,重點的是能夠幫助企業充分利舊,減少更新換代的一次性大量投入。

 

特邀講者 賴能和 副總工

中國石油集團東方地球物理公司研究院副總工程師、處理中心總工程師,教授級高級工程師。現任中國石油集團東方地球物理公司研究院副總工程師、處理中心總工程師。獲計算機軟件學士學位和地球物理碩士學位。自1983年以來一直從事地震數據處理軟件技術、高性能并行計算技術、存儲軟硬件技術以及信息化技術的研究與開發;負責完成了超過2.5萬顆CPU高性能并行機系統、35PB海量存儲系統的集成方案設計、軟硬件資源優化和數據中心機房建設、信息化建設等工作。

報告摘要:海量數據處理工業生產,對高性能并行計算系統提出了更高要求和全新挑戰。如何通過軟硬件優化配置和技術改進,解決大數據處理的瓶頸?如何構建穩定+高效+簡單+易用的海量存儲,提高HPC的應用效率?本報告通過大量應用實例,分析大數據處理對HPC效率的影響,提出了針對性的解決方案。

 

特邀講者 楊尚琴 主管師

CCF會員,2006年畢業于成都理工大學,2009年于成都理工大學獲得計算機碩士學位。2009年加入中國石化石油物探技術研究院地球物理軟件研究所。2010年獲英特爾Cilk技術應用競賽三等獎。主要研究多線程技術,MPI的特性,多層次并行及異構并行在地球物理行業上的應用。

報告摘要:回顧MPI的歷史,在此基礎上重點介紹MPI-3.0的3個主要新特性:鄰近集合通信,非阻塞的集合操作,擴展的單邊通信及其新特性的應用;最后探討MPI面臨的挑戰及趨勢。

 

特邀講者 魏彥杰 博士

2011年8月加入中國科學院深圳先進技術研究院。2004年獲得四川大學應用物理學學士學位,并于2007年12月獲得美國密歇根理工大學計算生物物理學博士學位。2008年3月到2011年6月在美國普林斯頓大學從事博士后研究。并分別于2005年7月到8月、2006年6月到7月、2007年5月到7月在德國馮諾依曼超級計算中心訪問。主要研究方向為蛋白質結構預測、生物信息學、高性能計算等。已發布學術論文20余篇,包括Proteins,Journal of Chemical Physics, Journal of Physical Chemistry B, Chemical Engnieering Sci.等著名期刊。在美國期間曾參與了美國自然科學基金(CHE-0313618),美國健康研究院(RO1-GM52032, R24-GM69736, GM628380),美國環境保護機構EPA(R 832721-010)等若干項目。

報告摘要:本報告將提出一種高效的并行 list ranking 算法,MEP-Ranking. 該算法通過在已有的 list ranking 算法中加入兩個額外的新的變量”lend”和”rend”用于記錄獨立集的選取切換的狀態,從而在空間復雜度和時間復雜度上均達到該算法復雜度下限‍

 

特邀講者 王澤寰 高性能計算開發技術工程師

畢業于北京郵電大學,現任NVIDIA 高性能計算開發技術工程師,主要負責多媒體方向GPU計算項目的開發和技術支持。協助多家企業開發過指紋識別,入侵檢測,車輛識別等多款基于GPU的產品。并且在分子動力學方向參與過大學與研究機構的多個重點項目。

報告摘要:二值圖像的連通區域標記算法是很多基于GPU視頻分析程序的瓶頸,快速的GPU實現有助于對此類應用程序進行加速。本報告基于”Label Equivalence”方法,提出了一種新的GPU算法。實現了2.2倍的性能提升。

 

特邀講者 郭貴鑫 高性能計算研發工程師

畢業于華南理工大學,現任深圳華大基因研究院高性能計算研發工程師,主要從事生物信息分析軟件的研發與優化,熟悉CUDA并行編程、MPI并行編程和pthread多線程編程,有較豐富的并行軟件移植、調試和優化經驗。

報告1摘要:完整準確的生物基因組是開展生物信息學研究的基礎,而基因組組裝是獲取該信息的常用方法。在基因組組裝的各個步驟中,對組裝圖的線性化步驟是計算密集型和內存訪存密集型兼具的一步,時間開銷非常大。本報告通過引入隨機list ranking算法對線性化步驟進行并行化,大幅減少其所用時間,并對其處理過程中產生并發送的消息量進行建模,準確的預測了整個過程中消息量大小的變化情況及趨勢,同時引入LogGP模型,結合消息量模型的結果,成功地實現了對通信時間開銷的定性預測。

報告2摘要:宏基因組主要研究特定環境中微生物的組成及與環境因素的交互關系,如人體腸道微生物菌群的平衡對維持人體健康至關重要。宏基因組的典型任務之一是對上千個樣本中包含的上百萬個基因按照樣本特征進行聚類分析,其計算復雜度高,耗時較長。本報告將給出如何使用GPU對聚類過程中的關鍵步驟進行加速,并通過對性能的逐步提升,最終在半分鐘內完成原本需要十幾小時的聚類分析。

 

執行主席 陳健 北京并行科技有限公司CEO

陳健現任北京并行科技有限公司CEO,并行科技主營業務數據中心在線運維及相關HPC軟件服務,并行科技是Intel軟件中國區總代理。2005年至2010年在英特爾中國歷任高性能計算架構師、資深性能優化工程師,負責中國大型HPC及前沿HPC項目系統架構設計、HPC系統的優化及高性能計算技術推廣,研究方向為高性能計算機系統架構、并行計算、應用軟件及系統調優。2002年至2005年任聯想集團高性能服務器事業部方案處經理,參與了聯想深騰萬億次、四萬億次超級計算機的研制。2002年畢業于清華大學工程力學系,獲流體力學博士學位,期間在荷蘭TUDelft大學做訪問學者一年。

 

執行主席 王健宗 博士

博士,CCF YOCSEF廣州副主席,CCF廣州執委,CCF大數據專家委員會委員。主要研究方向有大數據、云計算、存儲系統、深度學習、軟件定義生態系統,在相關領域發表學術論文20多篇,曾擔任網易公司大數據高級研究員、惠普公司云計算高級解決方案專家和美國萊斯大學電子與計算工程系研究員,獲得 IEEENAS 2012最佳論文獎,2009年度國家留學基金委公派留學獎學金獲得者。

 

會場方位圖

廣州番禺長隆酒店

Club活動地點

 


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